Du 2 au 5 avril 2024 : formation « Biologie virtuelle 3D » à Palevoprim
Equipe formatrice
Résumé du programme
Cette formation proposée par le laboratoire Palevoprim (UMR 7262 Université de Poitiers & CNRS Ecologie Environnement) a pour objectif de fournir des connaissances et des compétences sur l’utilisation des outils d’imagerie 3D en sciences naturelles, depuis l’acquisition et le traitement de données virtuelles (surfaces et structures internes d’un objet) jusqu’aux analyses statistiques dans le but de répondre à une problématique de recherche donnée.
Vous serez formés à la numérisation surfacique d’objets biologiques à diverses résolutions à travers l’utilisation d’un profilomètre (Leica DCM8) et d’un scanner 3D (Artec Space Spider). D’autre part, vous serez familiarisés avec les principes de la numérisation par rayons X de spécimens anatomiques (éléments squelettiques osseux et dentaires, tissus mous) afin d’accéder de manière non invasive aux structures internes de ces objets (CT, microCT, synchrotron). Des données 3D issues de scans CT et IRM seront traitées (par ex. reconstruction 3D de régions d’intérêt, travail sur la texture, le maillage, différents formats d’images et d’objets 3D) puis analysées (en particulier les paramètres morphométriques). Vous apprendrez également à extraire des données 3D disponibles à partir de ressources en ligne (par ex. MorphoMuseuM, Morphosource) et à utiliser les formats et les logiciels appropriés pour les exploiter. Enfin, vous suivrez une introduction aux méthodes d’impression de modèles 3D (imprimantes Zortrax M200+ et Raise3D PRO2+).
Les modèles virtuels ont pour vocation à la fois de fournir de la donnée scientifique mais aussi de constituer des archives essentielles au partage de données entre chercheurs et chercheuses, à la préservation et la valorisation des spécimens originaux et à l’enseignement des sciences naturelles (supports pédagogiques).
Liste des équipements
- Leica DCM8 (Leica Microsystems)
- Artec Space Spider (Artec 3D)
- Zortrax M200+ (Zortrax)
- Raise3D PRO2+ (Raise3D)
Durée de la formation
28 heures de formation (3h de cours, 25h de travaux pratiques)
Lieu
Laboratoire Palevoprim, bât. B35, 3ème étage, université de Poitiers.